Vodič
NAD+ i NADH: vodič kroz koenzim
NAD+ (nikotinamid-adenin-dinukleotid) nije peptid nego koenzim: mali molekul od dva nukleotida koji u ćeliji prenosi elektrone, prelazeći iz oksidovanog oblika NAD+ u redukovani NADH i nazad. Uz njega postoji i fosforilisani par, NADP+ i NADPH. Vodič poredi ta četiri oblika, prati imena pod kojima se koenzim vodio u starijoj literaturi i objašnjava zašto je njegov rastvor osetljiv na pH.
Specifikacije
- Čistoća
- ≥ 99%
- Oblik
- Liofilizovani prah u bočici
Šta je NAD+?
NAD+ je dinukleotid: dva nukleotida, jedan sa nikotinamidom i drugi sa adeninom, povezana su preko svojih fosfatnih grupa. Redoks posao obavlja nikotinamidni prsten, koji prima i predaje hidridni jon, pa koenzim prelazi iz oksidovanog oblika NAD+ u redukovani NADH i nazad. Znak plus u nazivu označava pozitivno formalno naelektrisanje na jednom atomu azota oksidovanog oblika.
Osim što prenosi elektrone, NAD+ služi i kao supstrat: troše ga reakcije ADP-ribozilacije i deacetilaze iz porodice Sir2, a iz njega nastaje i ciklična ADP-riboza, molekul koji u ćeliji mobiliše kalcijum. U bočici je oksidovani oblik, NAD+, kao liofilizovani prah. Sastav pojedinačne serije zavisi od proizvodnje, a ne od naziva jedinjenja, pa se kod dobavljača za tu seriju traži analitički nalaz — tečna hromatografija visokih performansi (HPLC) za čistoću i masena spektrometrija za identitet. Dok takav nalaz ne stoji uz seriju, navedena čistoća je deklaracija dobavljača, a ne izmerena vrednost.
Građa NAD+: jedan prsten, dva oblika
Tabela specifikacija uz ovaj vodič nosi dva podatka: deklarisanu čistoću i oblik u kom materijal stiže. Deklarisana čistoća je udeo imenovanog jedinjenja u materijalu, a ne sud o kvalitetu — ostatak do sto odsto čine tragovi samog postupka proizvodnje i prečišćavanja, a ne neko drugo jedinjenje. Podatak o obliku kaže šta je fizički u bočici, pa se i pre otvaranja zna da li je unutra suv prah ili gotov rastvor. Uslovi čuvanja nisu kataloški podatak; o njima je reč niže, u odeljku o rukovanju i čuvanju.
Razlika između NAD+ i NADH sedi u jednom prstenu. U oksidovanom obliku nikotinamidni prsten je piridinski; kada primi hidridni jon, postaje dihidropiridinski. Ta promena se vidi i u svetlosti koju molekul upija: oba oblika apsorbuju oko 260 nm, ali samo redukovani NADH ima i snažnu traku na 340 nm, a redukovani oblici NADH i NADPH uz to i fluoresciraju. Oksidovani NAD+ na 340 nm ne apsorbuje.
Dva oblika se razlikuju i po hemijskoj postojanosti. Oksidovani NAD+ razgrađuje se katalizom baza, pa ga visok pH ugrožava, dok se redukovani NADH razgrađuje katalizom kiselina i brže propada na niskom pH. Dva oblika istog koenzima, dakle, stradaju na suprotnim krajevima pH skale.
NAD+, NADH, NADP+ i NADPH: poređenje
Četiri oblika čine dva para. NADP+ se od NAD+ razlikuje jednom fosfatnom grupom više, na 2′ položaju riboze koja nosi adenin; tu grupu dodaje enzim NAD kinaza. Tabela poredi redoks stanje, tu fosfatnu grupu, apsorpciju na 340 nm i ulogu koju pregledna literatura pripisuje svakom obliku.
| Oblik | Redoks stanje | Fosfat na 2′ položaju riboze | Traka na 340 nm | Uloga u preglednoj literaturi |
|---|---|---|---|---|
| NAD+ | oksidovan | ne | ne apsorbuje | oksidativne, pretežno kataboličke reakcije; supstrat ADP-ribozilacije |
| NADH | redukovan | ne | apsorbuje; fluorescira | nosi elektrone iz ciklusa limunske kiseline ka oksidativnoj fosforilaciji |
| NADP+ | oksidovan | da | ne apsorbuje | nastaje iz NAD+ delovanjem NAD kinaze; prekursor NAADP-a |
| NADPH | redukovan | da | apsorbuje; fluorescira | reduktivna biosinteza i antioksidativna odbrana; pretežan oblik para |
Naziv NAD+ i literatura
Ime nikotinamid-adenin-dinukleotid čita se kao opis građe: nikotinamid, adenin i dva nukleotida. Skraćenica bez znaka, NAD, u preglednoj literaturi označava par u celini, i NAD+ i NADH, a na isti način NADP obuhvata NADP+ i NADPH. Zapis NAD(P)H koristi se kada signal potiče od oba redukovana oblika zajedno, jer se njihova fluorescencija po spektru ne može razdvojiti.
Istorija molekula duža je od njegovog imena. Harden i Young su 1906. u radu o alkoholnoj fermentaciji u soku kvasca opisali „koferment”: činilac iz prokuvanog i proceđenog ekstrakta kvasca čiji je dodatak znatno pojačavao fermentaciju u neprokuvanom ekstraktu. Von Euler i Warburg su kasnije izolovali čiste frakcije NAD+ i NADP+, a Warburg je 1936. pokazao da se redoks reakcije odigravaju upravo na nikotinamidnom delu molekula. U literaturi sredine dvadesetog veka isti koenzim stoji pod imenima difosfopiridin-nukleotid (DPN) i koenzim I. Pod imenom DPN naslovljen je, na primer, rad Preissa i Handlera iz 1958. o putu biosinteze koji danas nosi njihovo ime.
Za pretragu su zato korisni i današnji i stariji nazivi, kao i zbirni izraz piridinski nukleotidi, pod kojim se oba para obrađuju zajedno.
NAD+ u laboratorijskoj literaturi: signal, supstrat i reagens
Fluorescencija redukovanih oblika pretvorila je koenzim u sopstveni indikator. Od sredine dvadesetog veka unutrašnja fluorescencija NADH i NADPH koristi se za praćenje redoks stanja u živim tkivima, bez dodatog obeleživača. Pošto se spektri ta dva oblika ne razlikuju, signal se beleži kao NAD(P)H, a noviji radovi dva doprinosa razdvajaju po trajanju fluorescencije (Blacker i Duchen, 2016).
Drugi pravac tiče se ćelijskih odeljaka. NADP+ i NADPH ne prolaze kroz membrane, pa ćelija ima zasebne sisteme za njihovu sintezu u pojedinim odeljcima: kod sisara je NAD kinaza pretežno u citoplazmi, a druga NAD kinaza, NADK2, u mitohondrijama (Oka i saradnici, 2023). NADPH troše, između ostalih, glutation-reduktaza i tioredoksin-reduktaza, dva enzima koja ćeliji obezbeđuju redukcionu snagu za disulfidne veze; prvi od njih, kako mu i ime kaže, radi sa glutationom.
Treći pravac je tehnički. U biokatalizi bez ćelija, gde se enzimske reakcije izvode u reaktoru, prirodni koenzimi su skup sastojak, pa je njihova postojanost u uobičajenim puferima predmet zasebnih merenja (Wolfe i saradnici, 2024). Svi pomenuti podaci potiču iz in vitro sistema, izolovanih tkiva i životinjskih modela; vodič iz njih ne izvodi nijedno dejstvo jedinjenja.
Rukovanje i čuvanje
NAD+ je postojan kao suv prah, ali ne i u vodi: u rastvoru se razgrađuje katalizom baza, naročito pri visokom pH, a brzina razgradnje zavisi i od temperature i od izbora pufera. Zato se rastvor NAD+ priprema svež, neposredno pre upotrebe, a ako je u istom eksperimentu i NADH, pH se bira kao kompromis, jer NADH strada u kiseloj sredini.
Celovit postupak rekonstitucije i režim čuvanja pre i posle rastvaranja isti su za sve liofilizovane artikle u katalogu i opisani na stranici proizvoda, u odeljku „Isporuka, rekonstitucija i čuvanje”.
Česta pitanja
Šta je NAD+?
NAD+ (nikotinamid-adenin-dinukleotid) je koenzim sastavljen od dva nukleotida, jednog sa nikotinamidom i jednog sa adeninom, povezanih preko fosfatnih grupa. U ćeliji prenosi elektrone kao oksidovani član para NAD+/NADH. Mali je molekul, a ne peptid, i namenjen je isključivo istraživačkoj upotrebi.
Koja je razlika između NAD+ i NADH?
NAD+ je oksidovani, a NADH redukovani oblik istog koenzima; razlika je u nikotinamidnom prstenu, koji u NADH nosi primljeni hidridni jon. NADH apsorbuje svetlost na 340 nm i fluorescira, a NAD+ na toj talasnoj dužini ne apsorbuje. NAD+ se u rastvoru razgrađuje katalizom baza, a NADH katalizom kiselina.
Po čemu se NAD+ razlikuje od NADP+?
NADP+ ima jednu fosfatnu grupu više, na 2′ položaju riboze koja nosi adenin, a dodaje je enzim NAD kinaza. U preglednoj literaturi NAD+ se vezuje pretežno za oksidativne, kataboličke reakcije, a redukovani NADPH za reduktivnu biosintezu i antioksidativnu odbranu.
Pod kojim se još nazivima NAD+ javlja u literaturi?
Pod punim imenom nikotinamid-adenin-dinukleotid, kao NAD, što označava par NAD+ i NADH u celini, i u starijoj literaturi kao difosfopiridin-nukleotid (DPN) ili koenzim I. Zbirni izraz za NAD i NADP je piridinski nukleotidi.
Zašto se rastvor NAD+ priprema neposredno pre upotrebe?
Zato što se NAD+ u vodenom rastvoru razgrađuje katalizom baza, naročito pri visokom pH, a brzina razgradnje zavisi i od temperature i od izbora pufera. Rastvor pripremljen unapred zato vremenom sadrži sve manje NAD+.
Za koje je svrhe NAD+ namenjen?
Isključivo za laboratorijska istraživanja — rad in vitro i pretklinička ispitivanja na modelima. Nije namenjen ljudskoj upotrebi.
Izvori
Spoljašnji izvori za identifikaciju i hemiju jedinjenja.
- NAD — PubChemNational Library of Medicine
- NAD — ChEBIEuropean Bioinformatics Institute
- Harden i Young (1906): koferment soka kvasca — Proceedings of the Royal Society BThe Royal Society
- Preiss i Handler (1958): biosinteza koenzima, rad pod starijim nazivom DPN — PubMedNational Library of Medicine
- Croft i sar. (2020): pregled metabolizma NAD+ na modelu kvasca — PubMedNational Library of Medicine
- Pollak i sar. (2007): pregled piridinskih nukleotida — PubMedNational Library of Medicine
- Blacker i Duchen (2016): fluorescencija NADH i NADPH u tkivima — PubMedNational Library of Medicine
- Oka i sar. (2023): NAD kinaza i sinteza NADP — PubMedNational Library of Medicine
- Miller i Schmidt (2019): disulfid-reduktazni sistemi zavisni od NADPH — PubMedNational Library of Medicine
- Wolfe i sar. (2024): postojanost NAD+ i NADH u vodenim puferima — PubMedNational Library of Medicine
- Nicotinamide adenine dinucleotide — WikipediaWikipedia
Literatura i poređenja
Namenjeno isključivo za istraživačke svrhe — nije za ljudsku upotrebu.
Vodiči
Povezani vodiči
Članci